遗传学是引起习惯性流产的男性因素中的一个方面，其中男性染色体异常，发生平衡易位，就可以导致妻子流产。我们知道，人类的细胞中有23对（46条）染色体，正常人在形成生殖细胞时，初级精母细胞和初级卵母细胞必须经过减数分裂，使46条染色体一分为二，所以每个精子和卵子只含23条染色体。受精后，精卵融为一体，来自父母双方的23条染色体又结合成23对，形成正常的胚胎。
在有染色体易位的情况下，这种分配就会出现不均匀，异常的精子与正常卵子结合后就会形成异常的三体或单体受精卵（正常为双体）。单体形式的受精卵往往在胚胎发育早期就夭折，造成流产或死胎；三体形式的受精卵也很容易发生流产，即便能勉强活到出生，也一定是个先天性畸形儿，很难长大，或发育成为低能儿。
近年来，随着医学遗传学工作的开展，染色体检查技术的日益普及，已越来越多地发现，某些反复流产的原因是由于染色体不正常，并且双方不论谁的染色体异常，均可造成流产。染色体平衡易位的患者可是男的，也可是女的。这种携带者在人群中约占0.2%，即250对正常夫妇中就有一个携带者。但在发生过自然流产史的人群中，携带者占5%，这些人婚后生育时，可能会出现死胎、死产、流产和畸形儿等。
