治疗免疫性不育的原则是解除引起免疫反应的病因，抑制已有的免疫反应，去除精液或精子表面存在的自身抗精子抗体，以及减少或消除免疫原。对于不明原因的男子不育患者，应当考虑到自身免疫性不育的可能，有条件者应该进行精子凝集试验和制动试验。
免疫性不育一旦明确诊断，可采用如下治疗方法：
第一种，免疫抑制治疗：采用糖皮质激素。有些病人可根据配偶月经周期接受1～3个疗程后，有受孕的可能。但大剂量激素治疗时，近2/3的病人出现副反应，如体重增加、烦躁、情绪改变、痤疮、水肿、皮疹等。
第二种，睾丸反跳疗法：有少数自身免疫性不育的男子，精子数量并不减少，有的甚至很多，因此抗精子抗体的数量也骤增。可以采用大剂睾丸酮治疗，使精子数减少，直至无精状态，体内的抗精子抗体滴定度也会显著下降或消失。一旦停止治疗，待精子数量恢复正常之后，有的病人抗精子抗体数量并不再重新增加，这样就有可能使女方怀孕。
第三种，病因治疗：生殖系统感染时，输精管道水肿梗阻，以及微生物对血睾屏障的破坏均可引起抗体产生，导致不育。因此，对男性生殖道炎症应积极治疗，抗感染治疗越早、越及时越好，一般治疗期限以6～12个月为佳。对因睾丸组织损伤和附睾病变产生自身抗精子抗体导致不育者，应手术治疗，消除免疫反应的病灶，有可能改善生育能力。
第四种，精子洗涤和宫腔内人工授精。
第五种，中医药治疗：有人采用纯中药制剂还精煎，辅以小剂量强的松，治疗血清自身抗精子抗体阳性者，结果自身抗精子抗体消失率达95%。大量报告证实采用温阳补肾、填精益髓、活血化瘀、清热解毒的中药治疗后，活动精子平均向前运动速度随之加快，精液中脓细胞检测率也随之下降。
